1.装载量超过其理论量
由于双锥旋转真空干燥机的装载能力与材料的堆叠密度（指单位体积的材料质量）有关，材料的比例一般按0.6g/cm3计算。如果超过这一比例，在实际生产中仍按原理论装载材料。首先，它会影响材料的干燥效率；二，长期运行将降低电机、减速器和链轮链的使用寿命，直到无法使用。此外，一些制造商盲目追求生产和工人运行，不顾其填充率（实际装载量与干燥筒体积之比），导致双锥旋转真空干燥机设备运行和产品质量问题不断。值得一提的是，双锥旋转真空干燥机的填充率通常在30%~50%之间，不能超过60%。
2.空现象
一旦使用不当，双锥旋转真空干燥机在干燥过程中会出现真空管弯曲、密封损坏、过滤变形甚至断裂，这是由于外部空气（称为空）进入罐反冲过滤器，罐达到较高的真空度，会对正负气流产生强烈影响，损坏真空系统。
值得注意的是，物料干燥后，罐体需要清空。排空时，须用排气阀控制流量，即先稍微打开阀门，待罐内真空度逐渐降低后再慢慢增加。
3.真空度不能达到或过高
双锥旋转真空干燥机在干燥过程中经常出现真空度不足或过高，通常有三个原因：
（1）真空机械密封泄漏；
（2）真空管道泄漏或堵塞；
（3）过滤器堵塞。这需要在使用过程中进行检查、维护、清洁等。
4.噪音过大，进/出口泄漏
（1）由于双锥旋转真空干燥机地脚松动，蜗轮减速机损坏，轴承管损坏，链条损坏过松或过紧，只需定期检查，及时消除故障。
（2）只要更换密封条，进出口泄漏正常。